Условное обозначение
|
Скачать 279.59 Kb.
|
ПЕПТИДЫ Полипептиды образуются в результате реакции конденсации, протекающей между аминогруппой одной кислоты и карбоксильной группой другой:  Пептид, образованный двумя аминокислотами, называется дипептид, тремя трипептид и.т.д. Количество аминокислот в составе пептидов может сильно варьировать. Пептиды, содержащие до 10 аминокислотных остатков, называют олигопептидами. Часто в названии таких молекул указывают число аминокислот, входящих в состав данного олигопетида: дипептид, трипептид, тетрапептид, октапептид и.т.д. Пептиды, содержащие более 10 аминокислот, называют полипептидами. А полипептиды, содержащие более 50 аминокислотных остатков, обычно называют белками. Однако такие градации весьма условны: например, гормон глюкагон, состоящий из 29 аминокислот, называют белковым гормоном. Гормоны окситоцин и вазопрессин содержат всего по 9 аминокислотных остатков. Поэтому более удачным следует считать различие, проводимое на уровне структуры полимера, более сложном, чем простая аминокислотная последовательность и количественный состав пептида. Полипептиды представляют собой линейные, довольно гибкие молекулы, а длинные цепи белков свернуты в клубок или иную структуру. Многие белки могут иметь в своем составе группы небелкового характера (простетические группы), связанные с полиамидной цепью. Пептиды различаются по аминокислотному составу, количеству и порядку соединения аминокислот. Например, тетрапептиды сер-гис-про-ала и ала-гис-про-сер это два разных пептида, несмотря на то, что они имеют одинаковый качественный и количественный состав. Строение полипептидной цепи и пептидной связи Мономеры аминокислот, входящие в состав полипептидов, называют аминокислотными остатками. Аминокислотный остаток, имеющий свободную аминогруппу, называют N-концевым и записывают слева пептидной цепи, а имеющий свободную α-карбо-ксильную группу – С-концевым, и записывают справа. Цепь повторяющихся атомов –СН – СО – NH– в полипетидной цепи называется пептидным остовом. Полипептидная цепь имеет следующий общий вид:  где R1, R2, R3, … Rn – радикалы аминокислот, образующие боковую цепь. Hоменклатура пептидов При названии полипептида к названию всех аминокислотных остатков, кроме последнего, добавляют суффикс -ил, концевая аминокислота имеет окончание -ин. Например, пептид мет-асп-вал-про имеет полное название метиониласпарагилвалилпролин. Кислотно-основные свойства пептидов Многие короткие пептиды были получены в чистом кристаллическом виде. Высокие температуры их плавления указывают на то, что из нейтральных растворов пептиды кристаллизуются в виде диполярных ионов. Поскольку ни одна из α-карбоксильных групп и ни одна из α-аминогрупп, участвующих в образовании пептидных связей, не может ионизироваться в интервале рН от 0 до 14, кислотно-основные свойства пептидов определяются свободной NH2 группой N-концевого остатка и свободной карбоксильной группой С-концевого остатка пептида и теми R-группами, которые способны к ионизации. В длинных пептидных цепях число ионизированных R-групп обычно велико по сравнению с двумя ионизированными группами концевых остатков пептида. Поэтому для характеристики кислотно-основных свойств пептидов мы будем рассматривать короткие пептиды. Свободная α-аминогруппа и свободная концевая карбоксильная группа в пептидах разделены значительно большим расстоянием, чем в простых аминокислотах, и поэтому электростатические взаимодействия между ними ослаблены. Величины рK для концевых карбоксильных групп в пептидах несколько выше, а для концевых α-аминогрупп несколько ниже, чем в соответствующих свободных аминокислотах. У R-групп в коротких пептидах и в соответствующих свободных аминокислотах величины рK заметно не различаются. Для определения области рН, в которой может находиться изоэлектрическая точка исследуемого короткого пептида, достаточно сравнить число свободных аминогрупп и число свободных карбоксильных групп, включая N- и С-концевые группы. Если число аминогрупп превышает число карбоксильных групп, изоэлектрическая точка пептида будет лежать в щелочной области рН, так как для предотвращения протонирования аминогрупп необходима щелочь. Если число карбоксильных групп превышает число аминогрупп, изоэлектрическая точка будет находиться в кислой области рН, так как кислая среда подавляет диссоциацию карбоксильных групп. Определение структуры пептидов Для того чтобы выяснить структуру пептида, необходимо знать следующее: а) какие аминокислоты входят в состав полипептида; б) сколько аминокислот каждого вида содержится в пептиде; в) в какой последовательности эти аминокислоты связаны в цепи. Для определения состава пептида его подвергают гидролизу в горячей соляной кислоте с С(HCl) = 6 моль/л. Полученную смесь аминокислот анализируют на аминокислотном анализаторе и устанавливают качественный и количественный состав пептида. Зная весовое содержание каждой из полученных аминокислот, можно вычислить количество каждой кислоты и тем самым установить «эмпирическую формулу» пептида, т.е. относительное содержание остатков различных аминокислот в пептиде. Для вычисления «молекулярной» формулы пептида, то есть для установления действительного числа каждого из остатков в молекуле пептида, необходимо знать его молярную массу, которую определяют различными химическими или физическими методами. Наиболее трудная задача установить, в какой последовательности аминокислотные остатки связаны в пептид. Для решения этого вопроса используют комбинацию двух методов: определение концевых групп и частичный гидролиз. Идентификацию аминокислотных остатков на концах пептидной цепи проводят, используя их отличие от всех остальных звеньев и друг от друга: N-концевой остаток содержит свободную аминогруппу, а С-концевой остаток содержит свободную карбоксильную группу. Для идентификации N-концевого остатка используют метод Ф. Сенгера, который основан на реакции свободной аминогруппы пептида с динитрофторбензолом. Реакция протекает по механизму нуклеофильного замещения:  Замещенный пептид подвергают гидролизу, после чего N-концевой остаток, меченный динитрофенильной группой, выделяют и идентифицируют. N-концевая аминокислота с динитрофторбензолом дает устойчивое, окрашенное в желтый цвет, соединение, которое не разрушается при гидролизе. Огромный шаг вперед в химии анализа полипептидов был сделан в 1956 году, когда П. Эдман установил, что N-концевую аминокислоту можно удалить при помощи фенилизотиоцианата: (С6Н5 – N = C = S). В результате следующая за ней аминокислота становится N-концевой и её, в свою очередь, также можно удалить, действуя фенилизотиоцианатом. Этот метод определения N-концевых остатков получил название «метод деградации по Эдману». Наиболее успешным методом определения С-концевых остатков является не химический метод, а ферментативный. Избирательное удаление С-концевого звена осуществляется при помощи фермента карбоксипептидазы, которая расщепляет лишь ту пептидную связь, которая находится в α-положении к свободной α-карбоксильной группе в полипептидной цепи. Анализ можно повторить на укороченном пептиде, чтобы определить новую С-концевую кислоту. Однако на практике невозможно определить последовательность остатков аминокислот в длинной пептидной цепи путем ступенчатого удаления концевых остатков. Вместо этого пептид подвергают частичному гидролизу, при котором образуются фрагменты пептидов с укороченной цепью. Эти фрагменты идентифицируют при помощи метода определения концевых групп. Структура, приписанная пептиду и определенная вышеописанным методом, окончательно подтверждается синтезом этого пептида. |
Похожие:
 |
1. 1Полное наименование Системы и её условное обозначение 6 Подсистема информационного взаимодействия с информационными ресурсами Росреестра 14 |
 |
1. 1 Полное наименование системы и ее условное обозначение Полное наименование системы: Единая автоматизированная система учета кадров всех государственных предприятий "ас кадры" |
|
1Общие сведения 1Полное наименование системы и ее условное обозначение Полное наименование системы: Комплекс средств автоматизации «Единый центр оперативного реагирования г. Краснодар», создаваемый на... |
|
Типы и основные характеристики аккумуляторов и батарей Условное обозначение типа аккумуляторной батареи состоит из условного обозначения аккумуляторов и цифры перед буквами, означающей... |
|
Исо 2553 201 сварные и паяные швы условное обозначение на чертежах ( iso 2553: 2013, idt ) Российской Федерации установлены гост р 0-2012 «Стандартизация в Российской Федерации. Основные положения» и гост р 2-2014 «Стандартизация... |
|
Обозначение Наименование Страница Содержание 2 |
|
Обозначение Наименование Кол. Заводской номер |
|
Техническое описание и инструкция по эксплуатации Оглавление Формирователь акустических помех, условное наименование «Бубен», далее изделие, предназначен для работы в замкнутом пространстве... |
|
Руководство пользователя арм лечащего врача условное наименование «арм регион» Телемедицинская система для проведения дистанционных консультаций является собственной разработкой нп «Центр детской телемедицины... |
|
Межгосударственный стандарт Ссылочные нормативно-технические документы обозначение нтд, на который дана ссылка |
|
Обозначение Наименование Адаптер последовательного канала rs232/RS485 для вычислителя увп-280 кгпш 407374. 012 |
|
Комплекс стандартов на автоматизированные системы гост 34. 201-89 Виды, комплектность и обозначение документов при создании автоматизированных систем |
|
31. 03. 2016 Кузбасс fm спасатели Кузбасса покажут свои профессиональные навыки То есть, ликвидировать последствия автоаварии с пострадавшими. Спасатели потушат условное «возгорание», извлекут «потерпевших» из... |
|
Request for Taxpayer Identification Number and Certification Коммерческое обозначение/наименование организации, не являющейся юридическим лицом, если отличается от указанного выше |
|
Инструкция по общей эксплуатации и обслуживанию вакуумных устройств Обозначение се означает соответствие продукта европейским требованиям к охране здоровья, безопасности, окружающего пространства и... |
|
«Обнаружение и обозначение районов, подвергшихся радиоактивному,... Министерство Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий |