Скачать 3.04 Mb.
|
Актуальность темыГидролиз белков — важный этап в механизмах метаболизма белков в клетке. Гидролиз белковой молекулы перед поступлением ее в организм позволяет обойти возможные созданные природой защитные реакции организма от чужеродных белков. Гидролиз специфического белка, структура которого изменилась под влиянием внешних воздействий, позволяет удалить белок, утративший свою функцию и использовать повторно его аминокислоты для синтеза других белков. Многие секретируемые белки начинают свою жизнь с гидролитической реакции удаления сигнального пептида на мембранах эндоплазматической сети, а другие при участии гидролиза переходят в свои активные формы. В аналитических целях гидролиз широко используется при определении аминокислотного состава белков. Цель занятияСформировать представление о первичной структуре белковой молекулы. Познакомить со значением реакций гидролиза белков для процессов жизнедеятельности и в медицинской практике. Требования к исходному уровню знанийДля полного усвоения темы необходимо повторить из:
Для проверки исходного уровня знаний выполните следующие задания:Задание 1. 1.1. Объясните, почему пептидная группа является плоской и жесткой структурой? 1.2. Какие из перечисленных ниже реакций свойственны карбоксильным (1), а какие аминогруппам (2) аминокислот?
Правильность решений проверьте, сопоставив их с эталонами ответов. Вопросы для обсуждения
ЛИТЕРАТУРА
Задания для самостоятельной работы Задание 1. Вспомните, что в основе полипептидной цепи, построенной из -амино-кислот, лежит постоянно повторяющаяся структура NH-CH-CO. Свойства связей, формирующих эту структуру, позволили построить 2 основные модели расположения атомов этой структуры, названные -спиралью и -складчатой структурой. Главное условие стабильности такой структуры — максимум водородных связей, возникающих в пределах этой структуры. Включение иминокислоты пролина в цепь нарушает указанные условия. В построенных моделях не учитывалось влияние радикалов аминокислот и воды на поведение компонентов полипептидной цепи. 1.1. Что общего и каковы различия между моделями -спирали и -складчатой структуры? 1.2. Вычислите длину в нм цепи полипептида, состоящего из 105 остатков аминокислот, если он представлен как: a. Полностью -спираль. б. Полностью плоская -структура. 1.3. Напишите формулу дипептида гли-ала. Покажите связи остова цепи, которые разрешают свободное вращение атомов. 1.4. А. Какова роль пролина в формировании -спирали? Б. Напишите формулу трипептида: Ала-Про-Гли. В. Объясните, почему в этом пептиде невозможно образование H-связи, необходимой для стабилизации -спирали. 1.5. В следующем полипептиде выберите: А. Возможные места образования изгибов. Б. Возможные места образования внутрицепочечных ковалентных связей. В. Ряд из 3 остатков с боковыми цепями гидрофобной природы. Г. Ряд из 6 остатков с боковыми цепями гидрофильной природы.
Правильность ваших ответов сопоставьте с эталонами. Проверьте ваши знания (самоконтроль усвоения темы) Задание 1 А. Дитиотреитол — восстанавливающий агент. Что произойдет с дисульфидными мостиками после их обработки дитиотреитолом? Б. Сколько индивидуальных пептидов образуется после такой обработки изображенного фрагмента белка? Задание 2. Скорость синтеза -кератина во-лос. У человека рост волос — относительно медленный процесс, обычно 15–20 см в год. Весь этот рост сконцентрирован у корня волос, где -нити кератина синтезируются эпидермальными клетками Атом H у N в пептидной связи необходим для образования водородной связи с C=O на другой части белка или на другом белке. Задание 3. Пептид ферментативного гидролизата, не передвигающийся в электрическом поле при электрофорезе, дансилировали и выделили дансилпроизводное ЛЕЙ. Кислотный гидролиз пептида дал три пептида следующего состава: 1. ЦИС, АСП. 2. ТИР, ЛЕЙ. 3. ТИР, АСП, АРГ. Напишите формулу пептида, назовите пептид. В какой среде проводили электрофорез исходного гидролизата белка. Почему Вы так решили? Эталоны ответов к решению заданий Для самопроверки и самоконтроля исходного уровня знаний: 1.1. Пептидная группа с позиций электронного строения представляет собой трехцентровую p,-сопряженную структуру, в которой электронная плотность смещена в сторону более электроотрицательного кислорода. Атомы C, O, N, образующие сопряженную структуру, находятся в одной плоскости. Сопряжение выравнивает длины связей. Плоская сопряженная структура затрудняет вращение вокруг связи С-N.
Для самостоятельной работы: 1.1.
1.2. 105 аминокислотный полипептид А. В -спирали каждая аминокислота занимает 1,5 А=0,15 нм; поэтому полипептид 105 аминокислот — 15,8 нм в длину. Б. В -структуре каждая аминокислота занимает 3,5 А=0,35 нм; поэтому полипептид 105 аминокислот — 36,8 нм в длину (в 2 раза длиннее α-спирали с тем же самым числом остатков аминокислот!). 1.3. 1.4. А. Пролин позволяет -спирали поворачиваться под углом. Б. Ала-Про-Гли. В. Азот в пептидной связи, не образующий водородной связи в пептиде, обозначен *. Атом H у N в пептидной связи необходим для образования водородной связи с C=O на другой части белка или на другом белке. 1.5. А. Повороты в области каждого остатка Про — остатки # 7, 19, 28. Б. Поперечные связи по остаткам цистеина — остатки # 13, 24 могут формировать дисульфидный мостик. В. Остатки 1–3 гидрофобны. Г. Остатки 13–18 гидрофильны. Самостоятельная работа (60 минут) Инструкция к практическому занятию Кислотный гидролиз белка и формоловое титрование по Серенсену Гидролиз, проводимый в лабораторных условиях, является важным этапом на пути исследования первичной структуры белков. При кислотном гидролизе белка разрушаются некоторые аминокислоты: триптофан подвергается полному разрушению, а серин, треонин, цистеин, тирозин, фенилаланин — частичному. Однако процент разрушения этих аминокислот невелик. При щелочном гидролизе белка отмечается значительно более сильное разрушение аминокислот. Поэтому при анализе аминокислотного состава белка используют чистую 6 н HCl, которую добавляют к образцу белка и в запаянных ампулах гидролизуют при 120С на протяжении 24, 48 и 72 ч, что необходимо для расчета возможных потерь аминокислот при гидролизе. Гидролизаты белков (ферментативные или кислотные с добавлением триптофана) применяются в качестве лечебных препаратов для парентерального питания. Кислотный гидролиз. При кислотном гидролизе белки распадаются на высокомолекулярные пептиды, низкомолекулярные пептиды, дипептиды и аминокислоты. Полный гидролиз белка протекает при многочасовом кипячении раствора в круглодонной колбе с воздушным холодильником (см. рис.) в присутствии концентрированной хлористоводородной или серной кислоты. Формоловое титрование. Служит для определения количества карбоксильных групп, которое увеличивается вследствие разрыва пептидных связей в процессе гидролиза. Поскольку в водных растворах аминокислоты образуют внутримолекулярные соли без предварительного блокирования аминогрупп формальдегидом, непосредственно титровать карбоксильные группы аминокислот щелочью невозможно. П ринцип метода. В процессе реакции формальдегид блокирует -аминогруппу: Образующееся метиленовое соединение (метилен-аминокислота) оттитровывается щелочью с образованием Определяя количество карбоксильных групп титрованием, одновременно можно судить и о содержании аминных групп, так как количество титруемых карбоксильных групп эквивалентно количеству связанных формальдегидом аминных групп. Метод формолового титрования позволяет следить за ходом гидролиза белка и изучить действие протеолитических ферментов. При полном гидролизе белка количество аминных и карбоксильных групп в гидролизате перестает увеличиваться и биуретовая реакция становится отрицательной. Порядок выполнения работы.
Если при нейтрализации окраска делается ярко-красной (много NaОН), то добавляют до обесцвечивания по каплям 1 % раствор уксусной кислоты, избыток которой нейтрализуют 1 % раствором едкого натра до слабо-розовой окраски. Затем приливают 5 капель нейтрального 20 % раствора формалина. Вследствие блокирования аминогрупп формальдегидом и освобождения карбоксильных групп раствор приобретает кислую реакцию и фенолфталеин обесцвечивается. Обесцвеченный раствор титруют 0,005 н раствором NaOH до бледно-розового цвета и точно отмечают количество затраченной щелочи. Результаты титрования заносят в таблицу. Производят расчет азота аминогрупп по количеству затраченной щелочи, исходя из ее нормальности. Нормальному раствору щелочи соответствует 14 г азота в 1 л или 14 мг в 1 мл, 1 мл 0,005 н раствора соответствует 0,07 мг азота.
Результаты титрования
Выводы:Подпись преподавателя: Тема 3. Пространственная структура белков. Физико-химические свойства белков. МЕХАНИЗМЫ ОсаждениЯ белковАктуальность темы Изучение физико-химических свойств белков необходимо для понимания механизмов развития многих патологических состояний (например, отеков), механизмов транспорта веществ (в том числе лекарственных препаратов). На знании физико-химических свойств белков основано их получение и использование в качестве лекарственных препаратов. Реакции осаждения используются в медицине для качественного и количественного определения белка в биологических жидкостях, для удаления белков из растворов. Пробы коллоидоустойчивости используются для функциональной диагностики болезней внутренних органов. Цель занятия Закрепить знания о первичной структуре белка и ее роли в формировании пространственных структур молекулы. Сформировать представление о конформационных состояниях белковой молекулы и значении пространственной структуры в функционировании белков. Познакомиться с возможностями применения денатурации белков в медицинской практике. Требования к исходному уровню знаний Для полного усвоения темы необходимо повторить из:
Для проверки исходного уровня знаний выполните следующие задания: Задание 1. Укажите свойства, характерные для грубодисперсных систем: А. Интенсивное броуновское движение частиц. Б. Термодинамическая неустойчивость. В. Опалесценция. Г. Седиментация. Задание 2. Укажите свойства, отличающие суспензии от истинных растворов: А. Прозрачность. Б. Термодинамическая устойчивость. В. Гетерогенность. Г. Мутность. Задание 3. Укажите свойства, характеризующие коллоидные растворы: А. Низкое осмотическое давление. Б. Светорассеяние. В. Для частиц дисперсной фазы характерна седиментация. Г. Высокая диффузия частиц дисперсной фазы. Задание 4. Методы очистки коллоидных растворов основаны на следующих свойствах (выберите правильные варианты): А. Размеры частиц дисперсной фазы больше размеров частиц примесей. Б. Концентрация частиц дисперсной фазы больше концентрации частиц примесей. В. Диффузии частиц примесей через фильтр. Г. Диффузии частиц примесей через мембрану. Правильность решений проверьте, сопоставив их с эталонами ответов. Вопросы для обсуждения
ЛИТЕРАТУРА Основная
Дополнительная
Задания для самостоятельной работы Задание 1 1.1. Знать уровни структурной организации белков и основные связи, участвующие в их формировании. 1.2. Подобрать к каждому пронумерованному названию уровня структурной организации белка соответствующее понятие, обозначенное буквой:
1.3. Какому уровню структурной организации белка соответствует каждый пронумерованный тип связи? Подобрать пары.
Задание 2. Вспомните, что:
2 .1. Решите задачу. В активный центр белка входят 2 остатка аргинина, 1 остаток фенилаланина и 1 остаток валина (см. схему активного центра этого белка). Ответьте на вопросы: А. Какой из перечисленных лигандов с наибольшей вероятностью будет взаимодействовать с активным центром данного белка и почему? Б. Какие типы связей возникают в процессе образования комплекса «белок – лиганд»? Задание 3. Вспомнить основные реагенты и условия, вызывающие денатурацию. Ответить на вопросы: 3.1. Денатурация белка сопровождается: А. Изменением конформации белка. Б. Уменьшением растворимости белка. В. Изменением заряда белка. Г. Нарушением первичной структуры белка. 3.2. Белки денатурируют в клетке в результате: А. Повышения температуры. Б. Изменения рН. В. Действия протеолитических ферментов. Г. Разрыва слабых связей, поддерживающих конформацию белка. Д. Синтеза белков теплового шока. Задание 4. Знать строение и функции гемоглобина и миоглобина. Уметь дать сравнительную характеристику структуры и свойств этих белков. Ответить на вопрос: в ходе оксигенации гемоглобина происходит следующее: А. Изменение конформации первого протомера, затем второго и т. д. Б. Одновременное изменение конформаций всех протомеров. В. Изменение связей между протомерами. Г. Изменение валентности железа в гемах протомеров. Задание 5. Вспомнить, что белки являются амфолитами. Степень ионизации катионных и анионных групп, а следовательно, и заряд молекулы белка, зависит от значения рН среды. 5.1. Решите задачу. Определите суммарный заряд пентапептида при рН=7: глу-арг-лиз-вал-асп. Как изменится заряд этого пептида: а) при рН<7; б) при рН>7? 5.2. Усвоить понятия «изоэлектрическое состояние» и «изоэлектрическая точка» белка. Решите задачу. При каких значениях рН устойчивость растворов белков с изоэлектрическими точками 4,8; 5,3 и 6,1 будет наименьшей и почему? Задание 6. Знать факторы, влияющие на растворимость белков. Ответить на тестовый вопрос: Растворимость белков в водной среде определяется: А. Ионизацией белковой молекулы. Б. Гидратацией белковых молекул при растворении. В. Формой молекулы белка. Г. Способностью связывать природные лиганды. Правильность решений проверьте, сопоставив их с эталонами ответов. Проверьте ваши знания (самоконтроль усвоения темы) Задание 1. Подберите верные пары утверждений:
Задание 2. Центр связывания белка с лигандом представляет собой (выберите наиболее полный ответ): А. Совокупность радикалов аминокислот, сближенных на уровне третичной структуры. Б. Фрагмент полипептидной цепи. В. Участок поверхности белковой молекулы, комплементарный лиганду. Г. Простетическую группу белка. Д. Фрагмент пептидного остова. Задание 3. Лигандом -протомера гемоглобина может быть: А. Гем. Б. Кислород. В. -Протомер. Г. 2,3-бисфосфоглицерат. Д. -Протомер. Задание 4. Подберите верные пары утверждений:
Задание 5. В ядерных белках-гистонах содержится большое количество аминокислотных остатков аргинина и лизина, а в белке крови альбумине — много остатков глутаминовой и аспарагиновой кислот. Ответьте на вопросы:
Эталоны ответов к решению заданий Для самопроверки и самоконтроля исходного уровня знаний: 1 А, Г; 2 В, Г; 3 А, Б, В; 4 А, Г. Для самостоятельной работы: 1.2 (Б, Е – 1; Г – 2; А – 3; Д – 4; В – 5); 1.3 (А – 2, 3; Б – 4; В – 1, 3, 5, 6 ; Г 1, 3, 5); 2.1 (А – лиганд Б; Б – ионные, гидрофобные); 3.1 А, Б; 3.2 А, Б, Г; 4 А; 5.1 «0», а) «++», б) « »; 5.2 при рН=ИЭТ; 6 А, Б, В. |
3 альтернативные вопросы для текущего контроля, проводимого на каждом... Перед вами учебное пособие, составленное на основе многолетнего опыта работы преподавателей кафедры биологической химии медицинского... |
Инструкция по эксплуатации общие сведения Биотуалет «Компакт Люкс Турбо», предназначен для эффективной механической и биологической переработки уборных отходов жизнедеятельности... |
||
Рабочая программа по химии (7 класс, 1 час в неделю) ... |
Тематическое планирование курса «Химия в литературе, литература в химии» Основные нормативные свойства химического языкаСтановление и развитие языка химии, основные этапы развития химии |
||
Биологической очистки бытовых сточных вод Установки и станции биологической очистки бытовых сточных вод технологической серии «9» соответствуют общим техническим требованиям... |
27 мая 2011 года Президент Республики Татарстан Р. Н. Минниханов... Международному Году химии. На «День химии» в «Татнефть-Арену» организаторы – кгту пригласили руководство республики, руководителей... |
||
Паспорт учебного кабинета химии (№20) Извлечения из правил по технике безопасности при работе в кабинетах химии средних школ 17 |
Рабочая программа по химии в 9 классе на 201 Изучение химии на ступени основного общего образования направлено на достижение следующих целей |
||
Пояснительная записка Настоящая программа разработана на основе Примерных... Использована авторская программа среднего общего образования по химии для базового изучения химии в 10-11 классах по учебнику Г.... |
Приказ от 28 ноября 2006 г. N 450 Об утверждении клинико-организационного... ... |
||
Рабочая программа по химии для 10А класса 2 часа в неделю Примерной федеральной программы основного общего образования по химии для 8 – 11 классов |
Учебного кабинета химии кабинет №14 Перечень документов для организации Программа курса химии для 8-11 классов общеобразовательных учреждений (автор О. С. Габриелян) |
||
Рабочая программа элективного курса по химии «Решение расчетных задач по химии» (11 класс) Химия. М.: Просвещение, 2008. 56с.), в соответствии с федеральным компонентом государственного стандарта основного общего образования... |
Методические указания по лабораторному практикуму «птк асутп аэс» Ознакомление с оборудованием и программным обеспечением асу тп, применяемым на современных аэс россии |
||
Методические указания к практическим занятиям по общей, неорганической... Методические указания к практическим занятиям по общей, неорганической химии и органической предназначены для студентов специальности... |
Пояснительная записка рабочая программа составлена на основе: Федерального... Программы «Курса химии для 8–11 классов общеобразовательных учреждений» ( авт. О. С. Габриелян. – М.: Дрофа, 2006) |
Поиск |